2000年10月，省政府批準(zhǔn)組建江蘇省疾病預(yù)防控制中心，是直屬省衛(wèi)生健康委的公益性事業(yè)單位。2002年3月以來，增掛省衛(wèi)生檢測檢驗中心、省公共衛(wèi)生研究院。2024年1月，掛牌的省公共衛(wèi)生研究院更名為省預(yù)防醫(yī)學(xué)科學(xué)院?，F(xiàn)有江蘇路172號、邁皋橋122號兩座辦公區(qū)，下設(shè)22個業(yè)務(wù)部門、15個職能部門、1個臨時部門。單位核定編制695人，在職在編549人，其中高級專業(yè)技術(shù)職稱264人、碩士研究生以上學(xué)歷312人。建有國家突發(fā)急性傳染病防控隊、國家核和輻射突發(fā)事件衛(wèi)生應(yīng)急隊2支國家級應(yīng)急隊伍。獲批江蘇省發(fā)改委 衛(wèi)生應(yīng)急工程研究中心 、江蘇省衛(wèi)生健康委 十四五科教能力提升工程流行病學(xué)職業(yè)病學(xué) 重點(diǎn)學(xué)科、 疫苗臨床評價醫(yī)學(xué)創(chuàng)新中心 和 新發(fā)突發(fā)重大傳染病病原微生物重點(diǎn)實(shí)驗室 。
累計主持省部級以上科研項目146項，其中國家科技重大專項1項、科技部863計劃1項、國家自然科學(xué)基金項目36項（含優(yōu)青項目1項）、國家社會科學(xué)基金項目1項。榮獲各級各類科技獎180項，其中省部級科技一等獎4項、省部級其他獎項44項。累計發(fā)表論文5229篇，其中SCI論文1075篇。累計發(fā)布衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)201項，榮獲發(fā)明專利、軟件著作等知識產(chǎn)權(quán)301項。
中心堅持以習(xí)近平新時代中國特色社會主義思想為指導(dǎo)，在省委省政府和省衛(wèi)生健康委領(lǐng)導(dǎo)下，積極倡導(dǎo) 團(tuán)結(jié)、奮進(jìn)、求實(shí)、創(chuàng)新 疾控精神，履行省域傳染病疫情和突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急處置、實(shí)驗室檢驗檢測、應(yīng)用性技術(shù)研究、公共衛(wèi)生信息統(tǒng)籌管理和大數(shù)據(jù)分析利用、對外合作交流等職能。有效應(yīng)對 非典 、新冠病毒感染疫情，救援5.12汶川特大地震，處置9.14湯山投毒、嬰幼兒毒奶粉、地溝油、小龍蝦事件，援助非洲塞拉利昂抗擊埃博拉疫情，對口支援西藏拉薩、新疆伊犁和克州，保障北京奧運(yùn)、上海世博會等重大活動。高質(zhì)量推進(jìn)建設(shè)具有國際影響力的現(xiàn)代化疾控中心，服務(wù) 健康江蘇 ，獲中央文明委 全國文明單位 ，衛(wèi)生部等部委 抗震救災(zāi)醫(yī)藥衛(wèi)生先進(jìn)集體 ，人社部等部委 埃博拉出血熱疫情防控先進(jìn)集體 ，國家衛(wèi)生健康委 全國疾病預(yù)防控制工作先進(jìn)集體 ，原國家衛(wèi)生計生委、中華全國總工會 全國衛(wèi)生應(yīng)急技能競賽團(tuán)體一等獎 ，中華全國總工會 全國五一勞動獎狀 等表彰200余項。
